MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021030	AAT	2	6	253573	253578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185334
5502	NC_021030	AAAAT	2	10	253660	253669	80 %	20 %	0 %	0 %	479185335
5503	NC_021030	GGC	2	6	253703	253708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185335
5504	NC_021030	GGGCCG	2	12	253725	253736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185335
5505	NC_021030	CGA	2	6	253760	253765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5506	NC_021030	TCG	2	6	253857	253862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5507	NC_021030	GTG	2	6	253895	253900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185335
5508	NC_021030	ACGA	2	8	253965	253972	50 %	0 %	25 %	25 %	479185335
5509	NC_021030	GAG	2	6	254058	254063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185335
5510	NC_021030	GC	3	6	254064	254069	0 %	0 %	50 %	50 %	479185335
5511	NC_021030	CTG	2	6	254088	254093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5512	NC_021030	CGC	2	6	254119	254124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5513	NC_021030	CT	3	6	254166	254171	0 %	50 %	0 %	50 %	479185335
5514	NC_021030	GAG	2	6	254196	254201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185335
5515	NC_021030	AGA	2	6	254206	254211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185335
5516	NC_021030	GCC	2	6	254220	254225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5517	NC_021030	AAT	2	6	254247	254252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185335
5518	NC_021030	AGG	2	6	254254	254259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185335
5519	NC_021030	CGA	2	6	254288	254293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5520	NC_021030	GCC	2	6	254331	254336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5521	NC_021030	AGG	2	6	254341	254346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185335
5522	NC_021030	GCG	2	6	254347	254352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185335
5523	NC_021030	AATA	2	8	254376	254383	75 %	25 %	0 %	0 %	479185335
5524	NC_021030	TGC	2	6	254397	254402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5525	NC_021030	CTG	2	6	254415	254420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5526	NC_021030	GTC	2	6	254460	254465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5527	NC_021030	GCAC	2	8	254479	254486	25 %	0 %	25 %	50 %	479185335
5528	NC_021030	GCC	2	6	254499	254504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5529	NC_021030	GTTCG	2	10	254525	254534	0 %	40 %	40 %	20 %	479185335
5530	NC_021030	CGC	2	6	254588	254593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5531	NC_021030	CGA	2	6	254642	254647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5532	NC_021030	GC	3	6	254652	254657	0 %	0 %	50 %	50 %	479185335
5533	NC_021030	TGC	2	6	254662	254667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5534	NC_021030	TGC	2	6	254770	254775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5535	NC_021030	TGC	2	6	254794	254799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5536	NC_021030	CGT	2	6	254831	254836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5537	NC_021030	GAT	2	6	254855	254860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185335
5538	NC_021030	GCG	2	6	254869	254874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185335
5539	NC_021030	CTC	2	6	254876	254881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185335
5540	NC_021030	CGC	2	6	254908	254913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5541	NC_021030	CGC	2	6	254927	254932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185335
5542	NC_021030	CGGC	2	8	254935	254942	0 %	0 %	50 %	50 %	479185335
5543	NC_021030	GCCGCG	2	12	255060	255071	0 %	0 %	50 %	50 %	479185335
5544	NC_021030	TCG	2	6	255097	255102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5545	NC_021030	G	6	6	255102	255107	0 %	0 %	100 %	0 %	479185335
5546	NC_021030	ACC	2	6	255121	255126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185335
5547	NC_021030	CGA	2	6	255140	255145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5548	NC_021030	CCAATC	2	12	255205	255216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	479185335
5549	NC_021030	GGT	2	6	255221	255226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185335
5550	NC_021030	CGG	2	6	255274	255279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185335
5551	NC_021030	GTG	2	6	255330	255335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185335
5552	NC_021030	CGGTG	2	10	255338	255347	0 %	20 %	60 %	20 %	479185335
5553	NC_021030	GGA	2	6	255389	255394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185335
5554	NC_021030	GC	3	6	255400	255405	0 %	0 %	50 %	50 %	479185335
5555	NC_021030	TCG	2	6	255460	255465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5556	NC_021030	AGC	2	6	255487	255492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5557	NC_021030	ACG	2	6	255567	255572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5558	NC_021030	GCA	2	6	255586	255591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5559	NC_021030	CGA	2	6	255662	255667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5560	NC_021030	GTC	2	6	255671	255676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5561	NC_021030	ACT	2	6	255779	255784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185335
5562	NC_021030	ACG	3	9	255785	255793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185335
5563	NC_021030	GTGG	2	8	255804	255811	0 %	25 %	75 %	0 %	479185335
5564	NC_021030	GGT	2	6	256010	256015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021030	CGA	2	6	256076	256081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185336
5566	NC_021030	ATGC	2	8	256129	256136	25 %	25 %	25 %	25 %	479185336
5567	NC_021030	GCC	2	6	256141	256146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185336
5568	NC_021030	CGT	2	6	256172	256177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_021030	GCC	2	6	256184	256189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_021030	CCG	2	6	256216	256221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_021030	CAG	2	6	256254	256259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021030	TCCG	2	8	256263	256270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_021030	TCG	2	6	256315	256320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_021030	CGG	2	6	256352	256357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_021030	TCG	2	6	256390	256395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_021030	GGC	2	6	256404	256409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_021030	TCC	2	6	256426	256431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_021030	GC	3	6	256438	256443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_021030	CTTG	2	8	256480	256487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_021030	CGGAA	2	10	256519	256528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5581	NC_021030	GCC	2	6	256550	256555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_021030	CCT	2	6	256584	256589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185337
5583	NC_021030	CTG	2	6	256636	256641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5584	NC_021030	CGC	2	6	256674	256679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185337
5585	NC_021030	TCC	2	6	256706	256711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185337
5586	NC_021030	GAC	3	9	256714	256722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5587	NC_021030	GAT	2	6	256723	256728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185337
5588	NC_021030	CGC	2	6	256756	256761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185337
5589	NC_021030	GGA	2	6	256809	256814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185337
5590	NC_021030	GCC	2	6	256823	256828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185337
5591	NC_021030	GCGCC	2	10	256851	256860	0 %	0 %	40 %	60 %	479185337
5592	NC_021030	GAA	2	6	256882	256887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185337
5593	NC_021030	GCC	2	6	256933	256938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185337
5594	NC_021030	CTG	2	6	256963	256968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5595	NC_021030	CGATGA	2	12	256971	256982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479185337
5596	NC_021030	ACG	2	6	257033	257038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5597	NC_021030	TGA	2	6	257079	257084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185337
5598	NC_021030	ATC	2	6	257111	257116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185337
5599	NC_021030	GAT	2	6	257149	257154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185337
5600	NC_021030	TCG	2	6	257193	257198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5601	NC_021030	CAG	2	6	257200	257205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5602	NC_021030	GAC	2	6	257224	257229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5603	NC_021030	CAG	2	6	257236	257241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5604	NC_021030	GA	3	6	257261	257266	50 %	0 %	50 %	0 %	479185337
5605	NC_021030	CCA	2	6	257322	257327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185337
5606	NC_021030	ATG	2	6	257330	257335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185337
5607	NC_021030	CGA	2	6	257346	257351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185337
5608	NC_021030	GAACG	2	10	257356	257365	40 %	0 %	40 %	20 %	479185337
5609	NC_021030	CGC	2	6	257468	257473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_021030	ACG	2	6	257494	257499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_021030	A	6	6	257510	257515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021030	CCG	2	6	257525	257530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_021030	T	7	7	257545	257551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021030	CGGG	2	8	257560	257567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_021030	CTT	2	6	257572	257577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185338
5616	NC_021030	CGG	2	6	257592	257597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185338
5617	NC_021030	CGG	2	6	257625	257630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185338
5618	NC_021030	CGT	2	6	257644	257649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185338
5619	NC_021030	CTT	2	6	257692	257697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185338
5620	NC_021030	GCA	2	6	257727	257732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185338
5621	NC_021030	TCG	2	6	257768	257773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185338
5622	NC_021030	CCT	2	6	257784	257789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185338
5623	NC_021030	AGG	2	6	257808	257813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185338
5624	NC_021030	CTT	2	6	257818	257823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185338
5625	NC_021030	CTG	2	6	257836	257841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185338
5626	NC_021030	CG	3	6	257853	257858	0 %	0 %	50 %	50 %	479185338
5627	NC_021030	CTG	2	6	257884	257889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185338
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5633	NC_021030	CAGC	2	8	258126	258133	25 %	0 %	25 %	50 %	479185338
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5635	NC_021030	T	7	7	258147	258153	0 %	100 %	0 %	0 %	479185338
5636	NC_021030	T	6	6	258161	258166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5637	NC_021030	GTTT	2	8	258168	258175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5640	NC_021030	GCA	2	6	258237	258242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5672	NC_021030	CCG	3	9	259499	259507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5673	NC_021030	GCA	2	6	259599	259604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5730	NC_021030	C	9	9	262198	262206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5732	NC_021030	TTGC	2	8	262348	262355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5733	NC_021030	A	6	6	262446	262451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5734	NC_021030	TCG	2	6	262472	262477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5736	NC_021030	GTT	2	6	262620	262625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5737	NC_021030	CTT	2	6	262626	262631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5738	NC_021030	GCG	2	6	262649	262654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5739	NC_021030	TCCC	2	8	262716	262723	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5740	NC_021030	N	475	475	262768	263242	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_021030	A	6	6	263308	263313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_021030	GCGCC	2	10	263346	263355	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5743	NC_021030	GTTCG	2	10	263471	263480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5744	NC_021030	CGG	2	6	263491	263496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5745	NC_021030	CGG	2	6	263520	263525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5746	NC_021030	TAT	2	6	263563	263568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5748	NC_021030	TCT	2	6	263763	263768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6000	NC_021030	ACCGC	2	10	274402	274411	20 %	0 %	20 %	60 %	479185350

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